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SAGE法 : ウィキペディア日本語版
SAGE法
SAGE法(Serial Analysis of Gene Expression)とは、対象とする細胞組織における mRNA の発現状況を把握する、いわゆる遺伝子発現プロファイリングの為の分子生物学的手法である。
この技術はジョンズ・ホプキンス大学がんセンターに勤務していた Victor Velculescu 博士によって開発され、1995年にサイエンス誌に掲載された〔 PMID 7570003〕。それ以降幾つかの派生的手法が報告されているが、有名な改良版としては LongSAGE〔 PMID 11981567〕 や SuperSAGE〔 15617519〕 などが挙げられる。特に後者は 25-27 塩基対の長いタグを用いることで、遺伝子の正確なアノテーションゲノムからの新規遺伝子のより確実な発見を可能にする技術である。
== 手順の概要 ==
SAGE法の流れは以下の通り。
# 腫瘍などの試料から mRNA を単離する。
# 単離した mRNA の特定の位置から十~数十塩基対の配列(SAGEタグ)を分離する。
# SAGEタグ連結してある程度の長さの配列(コンカテマー)を作成する。
# コンカテマーをベクターに挿入し、バクテリアに導入してクローニングする。
# DNAシークエンシングを行って配列を決定する。
# 読まれた配列からそれぞれのSAGEタグを計数し、データを分析して発現状況を調べる。
より詳細な説明は欧州分子生物学研究所(EMBL)のサイト〔SAGE for Beginners 〕を参照。
また、CDNAの項に、類似手法が列記されている。

抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア(Wikipedia)
ウィキペディアで「SAGE法」の詳細全文を読む



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