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JAligner : ウィキペディア英語版
JAligner
JAligner is an open source Java implementation of the Smith-Waterman algorithm〔Smith TF and Waterman MS (1981). Identification of common molecular subsequences. ''J Mol Biol, 147:195-197''.〕 with Gotoh's improvement〔Gotoh O (1982). An improved algorithm for matching biological sequences. ''J Mol Biol, 162:705-708''.〕 for biological local pairwise sequence alignment using the affine gap penalty model. It was written by Ahmed Moustafa.
== See also ==

* Sequence alignment software
* Clustal

抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア(Wikipedia)
ウィキペディアで「JAligner」の詳細全文を読む



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