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Probalign : ウィキペディア英語版
Probalign
Probalign is a sequence alignment tool that calculates a maximum expected accuracy alignment using partition function posterior probabilities.〔U. Roshan and D. R. Livesay, Probalign: multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities, Bioinformatics, 22(22):2715-21, 2006 ((PDF ))〕 Base pair probabilities are estimated using an estimate similar to Boltzmann distribution. The partition function is calculated using a dynamic programming approach.
== Algorithm ==
The following describes the algorithm used by probalign to determine the base pair probabilities.〔(Lecture "Bioinformatics II" at University of Freiburg )〕

抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア(Wikipedia)
ウィキペディアで「Probalign」の詳細全文を読む



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