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GROMACS : ウィキペディア日本語版
GROMACS[ぐろーまっくす]

GROMACS(グローマックス、Groningen Machine for Chemical Simulations、グローニンゲン・マシン・フォー・ケミカル・シミュレーションズ)は、フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのソフトウェアパッケージである。フリーソフトウェアであり、GNU GPLライセンスに基づいて自由に改変することができる。
地球上で最速の分子動力学ソフトウェアを目指しており、並列計算を前提としたプログラミングがなされている。プログラムの大部分はC言語で記述されており、同じグループが以前に開発したGROMOS(FORTRAN 77ベース)が参考にされている。バージョン4.6時点に於いて、SSEAVXHPC-ACEなどの拡張命令を用いたアセンブリ言語のルーチンが実装されており、高速な計算が可能となっている。
力場はGROMACS、GROMOSOPLS-AA、AMBERCHARMMが標準で使用可能である。
==歴史==
GROMACSプロジェクトは1991年にオランダフローニンゲン大学生物物理化学科で始まった(1991年-2000年)。2001年からは、スウェーデン王立工科大学ウプサラ大学のGROMACS開発チームによって開発されている。

抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア(Wikipedia)
ウィキペディアで「GROMACS」の詳細全文を読む




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