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蛋白質構造データバンク（たんぱくしつこうぞうデータバンク、PDB; Protein Data Bank）は、蛋白質（タンパク質）と核酸の3次元構造の構造座標（立体配座）を蓄積している国際的な公共のデータベースである。PDBに蓄積されている構造データは、X線結晶解析法、NMR法（核磁気共鳴法）などによって実験的に決定されたデータである。なお、理論的な予測（蛋白質構造予測）で推定されたデータは蓄積していない。 世界中の生物学者や生化学者たちが、PDBに構造データを登録する。PDBに登録されたデータはパブリックドメインのもとで公開され、誰もが無償でアクセスすることができる。日本では大阪大学蛋白質研究所にその支所がある。 PDBは、生物学的構造データの中心的なデータベースである。構造生物学の研究で欠かせない情報源であり、また近年では構造ゲノミクスの研究でも重要なデータベースである。バイオインフォマティクスの研究でも、PDBに代表される3次元分子構造データベースは重要な研究対象である。PDBから派生したデータベースとプロジェクトは非常に多く、蛋白質の構造、機能、進化のそれぞれの側面から、PDBの構造データの統合や分類を行っている。 == 歴史 == 1971年に、アメリカ合衆国のブルックヘブン国立研究所がPDBを設立した。 1998年に、PDBの管理は同研究所から構造バイオインフォマティクス研究共同体 (RCSB; Research Collaboratory for Structural Bioinformatics) に移管され、同研究共同体 (RCSB) のプロジェクトの一つとなった。 2003年、RCSBを含む次の3つの研究組織により、Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) が結成され、PDBのデータの登録、データの処理、配布を行っている。2006年には生体分子磁気共鳴データバンク（BMRB）もメンバーに加わり、現在は4つの組織で運営されている〔Helen M. Berman, Gerard J. Kleywegt, Haruki Nakamura, John L. Markley,"The Protein Data Bank at 40: Reflecting on the Past to Prepare for the Future" (2012) Structure 20 pp391-396 doi:10.1016/j.str.2012.01.010 〕。 * 日本：日本蛋白質構造データバンク (PDBj) * 米国：構造バイオインフォマティクス研究共同体 (RCSB PDB) * 英国：欧州蛋白質構造データバンク (PDBe) * 米国：生体分子磁気共鳴データバンク（BMRB） wwPDBの役割は、PDBの生体高分子の3次元構造を蓄積した単一のデータベースの保守と、PDBデータベースを世界中の研究者コミュニティに無償で公開し利用できるようにすることである。 抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア（Wikipedia）』 ■ウィキペディアで「蛋白質構造データバンク」の詳細全文を読む 英語版ウィキペディアに対照対訳語「 Protein Data Bank 」があります。 スポンサード リンク
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