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Βバレル
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Βバレル
βバレル（Beta barrel）はタンパク質の三次構造の1つであり、大きなβシートがねじれてコイル状になり、両端が水素結合で結合した構造をしている。βバレル中のβストランドは通常は平行に配列している。この構造はポリンや、細胞膜を貫通する他のタンパク質、リポカリンなどの疎水性リガンドと結合するタンパク質で見られる。グラム陰性細菌の遺伝子の2-3%はポリン様のタンパク質をコードしている〔Wimley WC. (2003). "The versatile beta-barrel membrane protein". ''Curr Opin Struct Biol'' 13(4): 404–11. PMID 12948769.〕。
多くの場合、ストランドのアミノ酸は極性のものと疎水性のものが1つおきに並び、疎水残基はバレルの内側を向いて疎水性中心を作り、極性残基は外側を向いて溶媒に露出している。ただし脂質中ではこれとは逆になり、疎水性残基が外側、極性残基が内側にくることがある。
全てのβバレルは、βシート中のストランドの数を表すnとシートSという中のストランドのずれSという2つのパラメータによって分類される。これらのパラメータはβバレルの軸に対するストランドの偏向角に関係する〔Liu WM. (1998). "Shear numbers of protein beta-barrels: definition refinements and statistics". ''J Mol Biol'' 275(4): 5415. PMID 9466929.〕。
==βバレルのタイプ==
多くのβバレルは次の3つのうちのいずれかのトポロジーに分類される。
抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア（Wikipedia）』
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